Cell | 免疫疾病中免疫细胞特异基因调节动态全景图

2022-01-10 05:38:35 来源:
分享:

东京大学的学术研究工作人员和RIKEN Research学术研究所的朋友们仍然建立了首个针对自身免疫反应性传染病和自身发炎性传染病的遗传基因物质样品库。期望这一资源能为免疫反应传染病的发展提供新的观念,并不太可能有助药物的推断显露。研究小组们还期望,与免疫反应无关的原核生物样品图解最后不太可能应用于诸如COVID-19等传染病的学术研究。

东京大学概念设计学术研究助理,临床风湿病学家,功能性原核生物学专业人士Mineto Ota博士真是:“要认识传染病,就须要深刻解释遗传基因物质个体相似之处的功能性。有了这个样品集,我们就可以将与传染病无关的DNA氨基酸巨大变化的样品与对传染病发作组态十分重要的遗传基因物质和蛋白种类联系起来。”Ota是该团队发表在《Cell》Magazine上的评论的主要作者,评论标题为“Dynamic landscape of immune cell-specific gene regulation in immune-mediated diseases”。该概念设计是与Chugai Pharmaceutical的研究小组们合作透过的。

作者所述,免疫反应诱导的传染病(IMD)以外从自身免疫反应性到自身发炎的多种病理。他们指显露,尽管IMD当中炎性蛋白因子的异常社区活动表明免疫反应系统功能性发生了巨大变化,但是,“对于IMD的无关遗传基因物质甚至无关蛋白种类知之甚少。”

均原核生物相关联学术研究(GWAS)推断显露了许多与IMD无关的原核生物亚基。但是,在此类相关联学术研究当中深入学术研究显露的许多遗传基因物质个体相似之处都坐落于调节遗传基因物质“on”或“off”表达出来的DNA非编码区域,而不是坐落于遗传基因物质编码氨基酸当中。学术研究该小组指显露:“GWAS仍然探究了许多与繁杂基因型和传染病无关的原核生物亚基,以外IMD。这些个体相似之处当中的大多数都坐落于非编码原核生物区域,尤其是诱导元件,如增强子和启动子。”

为了探究诱导DNA的功能性,一种各不相异种类的原核生物分析,称为表达出来定量分析基因型遗传基因物质亚基(eQTL),力图将DNA氨基酸的相似之处与转录的相似之处联系起来。为了让eQTL样品,学术研究工作人员可以对诱导DNA氨基酸的意在、诱导氨基酸当中的个体相似之处如何影响其诱导遗传基因物质的表达出来以及这些转录相似之处如何随之而来传染病做显露越来越固执的传闻。

其它针对免疫反应的eQTL学术研究仍然在透过当中,但在此之后的学术研究工作只以外心理健康民间组织,并检查了受限制需求量的蛋白种类。学术研究工作人员所述:“对心理健康供体免疫反应系统的学术研究不太可能无法猎捕传染病状态下推断显露的一系列eQTL波动。此外,虽然对免疫反应系统的实验性焦虑可以在同样上模拟传染病状态,但却是却是反映显露人体内的环境因素环境。”

Ota补充道:“发炎状态下,免疫反应系统的物理属性与心理健康状态下的相异蛋白截然各不相异。与免疫反应情形无关的遗传基因物质个体相似之处不太可能只在患病状态下起效用,因此对于这种种类的遗传基因物质学术研究,从真实病患背上赚取样品十分重要。”

在他们最新报道的学术研究当中,学术研究该小组对79名心理健康民间组织和337名被诊断中风10种各不相异种类免疫反应诱导传染病(以外类风湿性关节炎、系统性自身免疫反应和系统性乳腺癌)的病患透过了均原核生物脱氧核糖核酸。所有民间组织都是日本裔。

认识免疫反应诱导的传染病具备挑战性,因为尽管每种传染病在临床上都是各不相异的,但仍有许多重叠之三处,并且具备相异诊断的病患不太可能会表现显露十分各不相异的症状。学术研究工作人员补充真是:“由于所有这些自然环境,一次学习一种免疫反应诱导传染病的灵活性是受限制的。但是,如果我们独自一人学术研究10种传染病,就可以越来越均面地认识这些种类的传染病。”

在收尾均原核生物脱氧核糖核酸后,学术研究工作人员从民间组织的血液样品当中制备28种各不相异种类的免疫反应无关蛋白,并测量了这些蛋白当中的转录。“我们在图解当中注意到,每种免疫反应系统种类都有各不相异的eQTL结果,这可以告诉我们蛋白种类中间遗传基因物质诱导的相似之处,以及哪种蛋白种类对于发展哪种传染病至关重要。”学术研究工作人员真是。

作者报告真是,“在转录分析当中,我们在一个的平台上对多个IMD透过比较,使我们很难描述每个传染病(病患)的构造,并辨认与单个传染病基因表达出来无关的遗传基因物质,以及在四组IMD当中肥胖的通道……我们的样品集使我们很难检测每个特定蛋白种类当中eQTL波动的环境因素(传染病)或多或少传动装置的电磁干扰。”

学术研究工作人员将得到的资源起名为东京大学免疫反应系统转录图解(ImmuNexUT),并真是它代表了使用东亚裔民间组织建立的最大的eQTL样品集。他们总结道:“我们确定了免疫反应系统种类基因表达出来的eQTL波动,以外以前未报道的引人注目蛋白种类,它们在环境因素发炎有条件下的自然环境,以及这些eQTL与IMD遗传基因中间的显著相关联。”

“到目前为止,在这一领域,大规模的原核生物和功能性原核生物学术研究主要是为了让欧陆人口为120人透过的,尽管群体自然环境对于精确解释原核生物功能性至关重要。”学术研究工作人员真是,“这个日本受试者的eQTL图解对于解决这种以欧陆为当中心的偏见,结合欧陆的样品集再进一步学术研究DNA个体相似之处的功能性,也具备重要意义。”

学术研究工作人员期望ImmuNexUT样品库将继续增长,并最后为病患带来越来越容易的结果。他们真是:“与之后报道的资源相比,我们的样品集具备独特而不利的在结构上,以外均面的免疫反应系统分作、人口为120人中间免疫反应情形的巨大变化以及表征的非欧陆人口为120人。”

分享: